桃驯化和育种的基因组印记

日前，中国农业科学院郑州果树研究所研究员王力荣团队与华中农业大学教授郭文武、美国康奈尔大学Boyce Thompson研究所教授费章君合作完成基于480份桃全基因组重测序解析桃育种历史的研究成果，在线发表于《基因组生物学》。该研究采用目前最大规模的桃重测序，揭示了桃驯化和改良的基因组印记，阐明桃果实大小和风味性状的分子演化机制，为桃全基因组选择育种提供支撑。

桃起源于我国，种质资源丰富。该研究团队对480份野生和栽培桃样本进行全基因组重测序，涵盖国家桃种质圃（郑州）1410份种质95%以上的遗传多样性，构建了迄今为止世界上最大的桃变异组数据库。利用变异组数据，对11个重要农艺性状进行全基因组关联分析，发现多个新位点，为分子标记的开发和分子育种提供了材料。

野生桃经过驯化和改良阶段的进化，果实外观、大小和品种均发生剧烈变化。通过比较基因组学，该研究阐明桃驯化和改良中人工选择的基因组区段，揭示桃如何由野生状态进化成为现今栽培状态的分子机制。

研究发现，桃果实大小的增加主要发生在驯化阶段，而果实风味相关的位点在驯化和改良阶段均受到强烈选择作用，但改良阶段选择的位点数目更多；苦涩味相关位点在驯化中基本已经丢失。另外，该研究还鉴定了低需冷量育种的目标区段，发现东方、西方桃改良阶段约50%的受选择基因组区段不同，从基因组层面解析了需冷量、肉质和风味相关基因的演化规律。

相关论文信息：DOI：10.1186/s13059-019-1648-9